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基本原理:
SNaPshot SNP分型是一种以单碱基延伸原理为基础,同时利用多重PCR对多个已知SNP 位点进行遗传分型的方法。在一个含有测序酶,四种荧光标记的ddNTP,紧挨多态位点5’端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI 3730或3100 测序仪跑胶后,根据峰的颜色可知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型,根据峰移动的胶位置确定该延伸产物对应的SNP位点。
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方法特点:
◆分型准确,其准确度达99.9%;
◆可多位点同时检测;
◆不受SNP位点多态特性限制;
◆不受样品个数的限制;
◆可以检测出受污染的样本;
适宜范围: 100-4000 samples,8-40 sites;
实例说明:
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◆分型样本(详见分型样本要求)
◆需要检测的SNP位点信息(如:SNP的rs号,或SNP位点上下游各200bp的确切序列及SNP位点的类型)
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◆课题的设计咨询,包括检测位点的选取;
◆DNA样本的质检;
◆SNP分型所用引物的设计、合成与优化;
◆SNaPshot SNP分型;
◆分型数据的质量评估。
注:对于质量保证的样本,SNP分型检出率98%以上。
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◆SNPs结果(ExceL表格);
◆原始SNP峰型图;
◆扩增和反应体系、所涉及的引物、探针序列;
◆分型数据的质量评估报告。 |
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服务费用和周期请来电咨询。
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